Archaea

  Halobacteria

•    Halobacteriales

  2

  2

  0

  0

  0

  0

  •    Halobacteriaceae

    2

    2

    0

    0

    0

    0

    •    Halobacterium

      1

      1

      0

      0

      0

      0

    •    unclassified Halobacteriaceae

      1

      1

      0

      0

      0

      0

•    Haloferacales

  1

  1

  0

  0

  0

  0

  •    Haloferacaceae

    1

    1

    0

    0

    0

    0

    •    Haloferax

      1

      1

      0

      0

      0

      0

•    Natrialbales

  3

  3

  0

  0

  0

  0

  •    Natrialbaceae

    3

    3

    0

    0

    0

    0

    •    Natrialba

      1

      1

      0

      0

      0

      0

    •    Natrinema

      2

      2

      0

      0

      0

      0

  Bacteria

435

140

51

183

19

42

  Actinobacteria

6

4

0

0

1

1

  Actinomycetia

6

4

0

0

1

1

•    Corynebacteriales

  1

  0

  0

  0

  1

  0

  •    Mycobacteriaceae

    1

    0

    0

    0

    1

    0

    •    Mycobacterium

      1

      0

      0

      0

      1

      0

•    Micrococcales

  2

  2

  0

  0

  0

  0

  •    Brevibacteriaceae

    1

    1

    0

    0

    0

    0

    •    Brevibacterium

      1

      1

      0

      0

      0

      0

  •    Microbacteriaceae

    1

    1

    0

    0

    0

    0

    •    Clavibacter

      1

      1

      0

      0

      0

      0

•    Propionibacteriales

  2

  2

  0

  0

  0

  0

  •    Propionibacteriaceae

    2

    2

    0

    0

    0

    0

    •    Acidipropionibacterium

      1

      1

      0

      0

      0

      0

    •    Propionibacterium

      1

      1

      0

      0

      0

      0

•    Pseudonocardiales

  1

  0

  0

  0

  0

  1

  •    Pseudonocardiaceae

    1

    0

    0

    0

    0

    1

    •    Amycolatopsis

      1

      0

      0

      0

      0

      1

  Bacteroidetes

24

8

0

10

0

6

  Bacteroidia

16
8
0
8
0
0

•    Bacteroidales

  16

  8

  0

  8

  0

  0

  •    Bacteroidaceae

    16

    8

    0

    8

    0

    0

    •    Bacteroides

      15

      7

      0

      8

      0

      0

    •    Phocaeicola

      1

      1

      0

      0

      0

      0

  Chitinophagia

1
0
0
0
0
1

•    Chitinophagales

  1

  0

  0

  0

  0

  1

  •    Chitinophagaceae

    1

    0

    0

    0

    0

    1

    •    Parafilimonas

      1

      0

      0

      0

      0

      1

  Cytophagia

2
0
0
0
0
2

•    Cytophagales

  2

  0

  0

  0

  0

  2

  •    Cyclobacteriaceae

    2

    0

    0

    0

    0

    2

    •    Algoriphagus

      2

      0

      0

      0

      0

      2

  Flavobacteriia

4
0
0
2
0
2

•    Flavobacteriales

  4

  0

  0

  2

  0

  2

  •    Flavobacteriaceae

    4

    0

    0

    2

    0

    2

    •    Flavobacterium

      4

      0

      0

      2

      0

      2

  Sphingobacteriia

1
0
0
0
0
1

•    Sphingobacteriales

  1

  0

  0

  0

  0

  1

  •    Sphingobacteriaceae

    1

    0

    0

    0

    0

    1

    •    Mucilaginibacter

      1

      0

      0

      0

      0

      1

  Cyanobacteria

1

0

0

0

0

1

  Oscillatoriophycideae

1
0
0
0
0
1

•    Oscillatoriales

  1

  0

  0

  0

  0

  1

  •    Oscillatoriaceae

    1

    0

    0

    0

    0

    1

    •    Moorena

      1

      0

      0

      0

      0

      1

  Firmicutes

41

17

0

0

18

6

  Bacilli

37
14
0
0
18
5

•    Bacillales

  22

  4

  0

  0

  14

  4

  •    Bacillaceae

    14

    1

    0

    0

    10

    3

    •    Bacillus

      13

      0

      0

      0

      10

      3

    •    Priestia

      1

      1

      0

      0

      0

      0

  •    Paenibacillaceae

    1

    0

    0

    0

    0

    1

    •    Paenibacillus

      1

      0

      0

      0

      0

      1

  •    Staphylococcaceae

    7

    3

    0

    0

    4

    0

    •    Staphylococcus

      7

      3

      0

      0

      4

      0

•    Lactobacillales

  15

  10

  0

  0

  4

  1

  •    Enterococcaceae

    5

    4

    0

    0

    1

    0

    •    Enterococcus

      5

      4

      0

      0

      1

      0

  •    Lactobacillaceae

    3

    3

    0

    0

    0

    0

    •    Lactobacillus

      3

      3

      0

      0

      0

      0

  •    Streptococcaceae

    7

    3

    0

    0

    3

    1

    •    Streptococcus

      7

      3

      0

      0

      3

      1

  Clostridia

4
3
0
0
0
1

•    Eubacteriales

  4

  3

  0

  0

  0

  1

  •    Clostridiaceae

    2

    2

    0

    0

    0

    0

    •    Clostridium

      2

      2

      0

      0

      0

      0

  •    Oscillospiraceae

    2

    1

    0

    0

    0

    1

    •    Ruminiclostridium

      1

      0

      0

      0

      0

      1

    •    Ruminococcus

      1

      1

      0

      0

      0

      0

  Proteobacteria

361

109

51

173

0

28

  Alphaproteobacteria

11
1
0
10
0
0

•    Hyphomicrobiales

  10

  0

  0

  10

  0

  0

  •    Nitrobacteraceae

    1

    0

    0

    1

    0

    0

    •    Bradyrhizobium

      1

      0

      0

      1

      0

      0

  •    Rhizobiaceae

    9

    0

    0

    9

    0

    0

    •    Agrobacterium

      9

      0

      0

      9

      0

      0

•    Rhodospirillales

  1

  1

  0

  0

  0

  0

  •    Acetobacteraceae

    1

    1

    0

    0

    0

    0

    •    Gluconacetobacter

      1

      1

      0

      0

      0

      0

  Betaproteobacteria

50
3
15
24
0
8

•    Burkholderiales

  41

  3

  14

  21

  0

  3

  •    Burkholderiaceae

    37

    3

    14

    20

    0

    0

    •    Burkholderia

      35

      3

      13

      19

      0

      0

    •    Cupriavidus

      1

      0

      1

      0

      0

      0

    •    Ralstonia

      1

      0

      0

      1

      0

      0

  •    Burkholderiales genera incertae sedis

    2

    0

    0

    0

    0

    2

    •    Methylibium

      1

      0

      0

      0

      0

      1

    •    Rhizobacter

      1

      0

      0

      0

      0

      1

  •    Comamonadaceae

    1

    0

    0

    1

    0

    0

    •    Acidovorax

      1

      0

      0

      1

      0

      0

  •    Oxalobacteraceae

    1

    0

    0

    0

    0

    1

    •    Janthinobacterium

      1

      0

      0

      0

      0

      1

•    Neisseriales

  9

  0

  1

  3

  0

  5

  •    Neisseriaceae

    9

    0

    1

    3

    0

    5

    •    Neisseria

      6

      0

      1

      0

      0

      5

    •    Snodgrassella

      3

      0

      0

      3

      0

      0

  Deltaproteobacteria

14
0
0
4
0
10

•    Myxococcales

  14

  0

  0

  4

  0

  10

  •    Myxococcaceae

    14

    0

    0

    4

    0

    10

    •    Corallococcus

      7

      0

      0

      0

      0

      7

    •    Myxococcus

      7

      0

      0

      4

      0

      3

  Epsilonproteobacteria

1
1
0
0
0
0

•    Campylobacterales

  1

  1

  0

  0

  0

  0

  •    Helicobacteraceae

    1

    1

    0

    0

    0

    0

    •    Wolinella

      1

      1

      0

      0

      0

      0

  Gammaproteobacteria

285
104
36
135
0
10

•    Aeromonadales

  6

  0

  0

  6

  0

  0

  •    Aeromonadaceae

    6

    0

    0

    6

    0

    0

    •    Aeromonas

      6

      0

      0

      6

      0

      0

•    Alteromonadales

  1

  0

  0

  0

  0

  1

  •    Pseudoalteromonadaceae

    1

    0

    0

    0

    0

    1

    •    Pseudoalteromonas

      1

      0

      0

      0

      0

      1

•    Enterobacterales

  144

  69

  23

  51

  0

  1

  •    Enterobacteriaceae

    99

    56

    16

    27

    0

    0

    •    Citrobacter

      2

      1

      0

      1

      0

      0

    •    Enterobacter

      5

      0

      1

      4

      0

      0

    •    Escherichia

      57

      28

      13

      16

      0

      0

    •    Klebsiella

      17

      14

      2

      1

      0

      0

    •    Salmonella

      15

      10

      0

      5

      0

      0

    •    Shigella

      3

      3

      0

      0

      0

      0

  •    Erwiniaceae

    2

    0

    0

    2

    0

    0

    •    Pantoea

      2

      0

      0

      2

      0

      0

  •    Hafniaceae

    5

    2

    0

    3

    0

    0

    •    Edwardsiella

      3

      0

      0

      3

      0

      0

    •    Hafnia

      2

      2

      0

      0

      0

      0

  •    Morganellaceae

    4

    0

    2

    2

    0

    0

    •    Photorhabdus

      2

      0

      1

      1

      0

      0

    •    Proteus

      1

      0

      0

      1

      0

      0

    •    Xenorhabdus

      1

      0

      1

      0

      0

      0

  •    Pectobacteriaceae

    13

    7

    1

    4

    0

    1

    •    Dickeya

      5

      0

      1

      3

      0

      1

    •    Pectobacterium

      8

      7

      0

      1

      0

      0

  •    Yersiniaceae

    21

    4

    4

    13

    0

    0

    •    Serratia

      12

      1

      0

      11

      0

      0

    •    Yersinia

      9

      3

      4

      2

      0

      0

•    Methylococcales

  1

  0

  0

  1

  0

  0

  •    Methylococcaceae

    1

    0

    0

    1

    0

    0

    •    Methylomonas

      1

      0

      0

      1

      0

      0

•    Moraxellales

  21

  0

  8

  13

  0

  0

  •    Moraxellaceae

    21

    0

    8

    13

    0

    0

    •    Acinetobacter

      21

      0

      8

      13

      0

      0

•    Pseudomonadales

  68

  29

  5

  34

  0

  0

  •    Pseudomonadaceae

    68

    29

    5

    34

    0

    0

    •    Pseudomonas

      68

      29

      5

      34

      0

      0

•    Thiotrichales

  6

  0

  0

  6

  0

  0

  •    Francisellaceae

    6

    0

    0

    6

    0

    0

    •    Francisella

      6

      0

      0

      6

      0

      0

•    Vibrionales

  24

  0

  0

  24

  0

  0

  •    Vibrionaceae

    24

    0

    0

    24

    0

    0

    •    Vibrio

      24

      0

      0

      24

      0

      0

•    Xanthomonadales

  14

  6

  0

  0

  0

  8

  •    Xanthomonadaceae

    14

    6

    0

    0

    0

    8

    •    Lysobacter

      3

      0

      0

      0

      0

      3

    •    Stenotrophomonas

      5

      2

      0

      0

      0

      3

    •    Xanthomonas

      6

      4

      0

      0

      0

      2

  Thermotogae

2

2

0

0

0

0

  Thermotogae

2
2
0
0
0
0

•    Thermotogales

  2

  2

  0

  0

  0

  0

  •    Thermotogaceae

    2

    2

    0

    0

    0

    0

    •    Thermotoga

      2

      2

      0

      0

      0

      0